"...Сделали видеофайл альфа-каналом с учётом рекомендаций. В TrimEditor видео корректно отображается с альфа-каналом. Однако в эфире из расписания альфа не работает и файл показывается без прозрачности. Как корректно использовать такие файлы в плейлисте для выхода в эфир?..."
Файлы с прозрачностью необходимо проигрывать только через титры.
Например, в своём титровальном проекте создать объект с элементом "АнимЛого" и загрузить его в OnAir3. Далее с помощью команд расписания или в ручном режиме управлять показом.
Команды управления титрами в расписание добавляются со странички OnAir3 "Титровальные объекты". Подробнее здесь.