"...Возник технический вопрос: будет ли плата FD722 работать в порту PCI-E? Не в мини-слоте, а полноформатном..."
Да, будет.
Плата FD722 будет работать в любом слоте PCI-E.
И в x1 (в вашей терминологии - мини), и в х16 (в вашей терминологии - полноформатном).