Двухканальный режим - нужна регистрация, чтобы появился выбор выходов?

"...Сейчас из выбора в настройках OnAir3 есть только один выход платы. Подозреваю, что это связано с ограничением лицензии?..."

Да, необходимо приобрести лицензию для работы в двухканальном режиме. 

Новую лицензию нужно применить на вещательном сервере. В программе FDConfig2 перевести плату в режим двойного выхода (Double SDI).

После этого в программе OnAir3 в настройках в разделе "Конфигурация" (1) в списке "Видеоустройство" (2) будет доступен второй выход платы (3).