"...Программа AudioNormalizer почему-то не закрывается обычным способом (по "крестику"), а вместо этого сворачивается в трей..."
Да, программа по "крестику" не закрывается, а сворачивается в область уведомлений (системный трей). Это нормальное поведение программы, т.к. анализ звука в файлах она ведёт в фоновом режиме. Для того, чтобы её закрыть, есть кнопка "Выход" в правом нижнем углу программы.