"...Используем плату FD788 и программное обеспечение Форвард ТА в конфигурации выхода 1080p50. Можно ли в расписание ставить видеофайлы с другой частотой кадров? И какие могут возникнуть проблемы при использовании видеофайлов с разной частотой кадров?..."
Да, в расписании могут быть файлы с разной частотой кадров.
Частота кадров при воспроизведении видеофайлов должна соответствовать частоте кадров на выходе платы. Поэтому при воспроизведении видеофайлов с частотой больше, чем на выходе платы (например, 1080p60), "лишние" кадры будут пропускаться. А если в видеофайле частота меньше, чем на плате (например, 1080p30), то часть кадров будет дублироваться.
В обоих случаях изображение при показе будет неравномерным.