Создаём новое, ломаем старое
"...Как нужно разделить srt-файл, чтобы субтитры показывались на разных частях фильма? Используем скрипт TS1_SubTitles..."
Файл субтитров srt делить на части не нужно. Скрипт TS1_SubTitles сам сформирует субтитры для разных частей фильма.