"...Предполагаем начать процесс перехода с SD на HD. Можно ли после перехода какое-то время работать с файлам 1280х720, учитывая, что на выходе должно быть два потока SD и HD с разрешением 1920х1080? Можно ли заменять имеющиеся материалы постепенно на материалы Full HD? Или это лучше сделать до перехода?..."
В расписании вещания одновременно могут находиться файлы любого разрешения (SD 720х576, HD 1280х720 или 1920х1080) вне зависимости от разрешения на выходе.
Никаких специальных действий до перехода на HD-вещание предпринимать не нужно. Можно постепенно замещать имеющиеся материалы на файлы в HD-разрешении.
Подробнее здесь.