"...Про посылку сообщений из одного экземпляра OnAir3 в другой известно. А можно ли послать сообщение самому себе? Т.е. в пределах одного экземпляра. Например, выключить логотип..."
Да, можно. Вместо названия машины нужно указать localhost.
Например:
Выключить показ титровального объекта:
localhost/FDOnAir1 OnAir1.Mirror Player.SetTitleObject {Logo} 0
Про настройку посылки команд подробно описано здесь. Список всех команд, которые можно использовать, там же по ссылке.