"...Для показа видеофайла с альфаканалом в конце одного ролика и в начале другого нужно как-то составлять расписание?..."
Для показа видеофайла с альфаканалом в конце одного ролика и в начале другого используется бесплатный скрипт TSF_Transitions.
В расписании в комментарии нужно будет указать какой именно файл с альфаканалом нужно проигрывать. Если в расписании используется только один файл-перебивка, то его название можно не указывать, оно будет взято из свойства скрипта "Переход по умолчанию".
Описание скрипта здесь.