"...Есть плата FD722, используется для вещания одного канала (Форвард ТА). Планируем приобретать лицензию для вещания второго канала на этой же плате. Могут ли возникнуть проблемы с титрованием?..."
Нет, не могут.
Выходы на плате FD722 в двухканальном режиме работают абсолютно независимо. Образно можно представить, что у вас на сервере не одна плата, а две. И на каждой вещается свой канал. Или как-будто у вас вообще два разных сервера, каждый из которых вещает по одному каналу. Поэтому никаких проблем с титрованием (вроде наложения титров на не тот канал вещания) быть не может.